Protein–RNA interactions for Protein: P17482

HOXB9, Homeobox protein Hox-B9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB9P17482 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HOXB9P17482 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms