Protein–RNA interactions for Protein: P16219

ACADS, Short-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSP16219 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ACADSP16219 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ACADSP16219 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ACADSP16219 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ACADSP16219 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ACADSP16219 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ACADSP16219 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ACADSP16219 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACADSP16219 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACADSP16219 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACADSP16219 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACADSP16219 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACADSP16219 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACADSP16219 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACADSP16219 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACADSP16219 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACADSP16219 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACADSP16219 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACADSP16219 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ACADSP16219 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ACADSP16219 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACADSP16219 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACADSP16219 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACADSP16219 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACADSP16219 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACADSP16219 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACADSP16219 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACADSP16219 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACADSP16219 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACADSP16219 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACADSP16219 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACADSP16219 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACADSP16219 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ACADSP16219 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACADSP16219 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACADSP16219 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ACADSP16219 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACADSP16219 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ACADSP16219 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ACADSP16219 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ACADSP16219 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACADSP16219 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ACADSP16219 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACADSP16219 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACADSP16219 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACADSP16219 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ACADSP16219 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACADSP16219 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACADSP16219 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACADSP16219 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ACADSP16219 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ACADSP16219 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACADSP16219 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
ACADSP16219 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACADSP16219 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ACADSP16219 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ACADSP16219 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ACADSP16219 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ACADSP16219 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ACADSP16219 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
ACADSP16219 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ACADSP16219 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ACADSP16219 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACADSP16219 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACADSP16219 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACADSP16219 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACADSP16219 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACADSP16219 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACADSP16219 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACADSP16219 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ACADSP16219 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ACADSP16219 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ACADSP16219 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ACADSP16219 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACADSP16219 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACADSP16219 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACADSP16219 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACADSP16219 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACADSP16219 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACADSP16219 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACADSP16219 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACADSP16219 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACADSP16219 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ACADSP16219 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACADSP16219 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACADSP16219 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACADSP16219 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACADSP16219 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ACADSP16219 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ACADSP16219 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ACADSP16219 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACADSP16219 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACADSP16219 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACADSP16219 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACADSP16219 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACADSP16219 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACADSP16219 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACADSP16219 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACADSP16219 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACADSP16219 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms