Protein–RNA interactions for Protein: P14867

GABRA1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA1P14867 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABRA1P14867 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms