Protein–RNA interactions for Protein: P14678

SNRPB, Small nuclear ribonucleoprotein-associated proteins B and B', humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPBP14678 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 KRTAP4-4-201ENST00000390661 1081 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 RN7SL275P-201ENST00000582762 335 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
SNRPBP14678 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 BNIP3P41-202ENST00000616656 861 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPBP14678 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms