Protein–RNA interactions for Protein: P13500

CCL2, C-C motif chemokine 2, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL2P13500 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL2P13500 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL2P13500 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL2P13500 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL2P13500 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL2P13500 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL2P13500 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL2P13500 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL2P13500 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL2P13500 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL2P13500 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL2P13500 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL2P13500 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL2P13500 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL2P13500 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL2P13500 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL2P13500 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL2P13500 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL2P13500 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL2P13500 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL2P13500 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL2P13500 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL2P13500 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL2P13500 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL2P13500 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL2P13500 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL2P13500 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL2P13500 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL2P13500 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL2P13500 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL2P13500 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL2P13500 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL2P13500 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL2P13500 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL2P13500 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL2P13500 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL2P13500 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL2P13500 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL2P13500 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL2P13500 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL2P13500 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL2P13500 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL2P13500 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL2P13500 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL2P13500 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL2P13500 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL2P13500 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL2P13500 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL2P13500 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL2P13500 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL2P13500 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL2P13500 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL2P13500 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL2P13500 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL2P13500 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL2P13500 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL2P13500 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL2P13500 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL2P13500 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL2P13500 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL2P13500 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL2P13500 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL2P13500 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL2P13500 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL2P13500 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL2P13500 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL2P13500 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL2P13500 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL2P13500 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL2P13500 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL2P13500 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL2P13500 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL2P13500 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL2P13500 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL2P13500 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL2P13500 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL2P13500 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL2P13500 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL2P13500 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL2P13500 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL2P13500 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL2P13500 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL2P13500 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL2P13500 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL2P13500 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL2P13500 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL2P13500 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL2P13500 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL2P13500 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL2P13500 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL2P13500 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL2P13500 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL2P13500 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL2P13500 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL2P13500 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL2P13500 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL2P13500 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL2P13500 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL2P13500 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL2P13500 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms