Protein–RNA interactions for Protein: P12882

MYH1, Myosin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,939 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYH1P12882 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MYH1P12882 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MYH1P12882 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MYH1P12882 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MYH1P12882 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MYH1P12882 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MYH1P12882 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MYH1P12882 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MYH1P12882 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MYH1P12882 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
MYH1P12882 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MYH1P12882 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MYH1P12882 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MYH1P12882 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MYH1P12882 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
MYH1P12882 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MYH1P12882 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MYH1P12882 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MYH1P12882 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MYH1P12882 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MYH1P12882 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MYH1P12882 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MYH1P12882 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MYH1P12882 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MYH1P12882 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MYH1P12882 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MYH1P12882 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MYH1P12882 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MYH1P12882 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
MYH1P12882 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
MYH1P12882 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MYH1P12882 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MYH1P12882 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MYH1P12882 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MYH1P12882 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MYH1P12882 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MYH1P12882 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MYH1P12882 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MYH1P12882 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MYH1P12882 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
MYH1P12882 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MYH1P12882 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MYH1P12882 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MYH1P12882 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MYH1P12882 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MYH1P12882 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MYH1P12882 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MYH1P12882 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MYH1P12882 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MYH1P12882 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MYH1P12882 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MYH1P12882 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MYH1P12882 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MYH1P12882 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MYH1P12882 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MYH1P12882 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MYH1P12882 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
MYH1P12882 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MYH1P12882 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MYH1P12882 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MYH1P12882 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MYH1P12882 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MYH1P12882 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MYH1P12882 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MYH1P12882 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MYH1P12882 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MYH1P12882 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MYH1P12882 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MYH1P12882 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MYH1P12882 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MYH1P12882 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MYH1P12882 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MYH1P12882 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MYH1P12882 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MYH1P12882 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MYH1P12882 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MYH1P12882 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MYH1P12882 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MYH1P12882 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MYH1P12882 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
MYH1P12882 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
MYH1P12882 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MYH1P12882 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MYH1P12882 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MYH1P12882 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MYH1P12882 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MYH1P12882 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MYH1P12882 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MYH1P12882 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MYH1P12882 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MYH1P12882 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MYH1P12882 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
MYH1P12882 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MYH1P12882 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MYH1P12882 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MYH1P12882 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MYH1P12882 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MYH1P12882 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MYH1P12882 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
MYH1P12882 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.9 ms