Protein–RNA interactions for Protein: P12645

BMP3, Bone morphogenetic protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP3P12645 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BMP3P12645 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BMP3P12645 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BMP3P12645 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
BMP3P12645 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BMP3P12645 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BMP3P12645 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BMP3P12645 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BMP3P12645 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BMP3P12645 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BMP3P12645 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BMP3P12645 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
BMP3P12645 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BMP3P12645 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BMP3P12645 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BMP3P12645 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
BMP3P12645 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BMP3P12645 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BMP3P12645 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
BMP3P12645 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BMP3P12645 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BMP3P12645 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BMP3P12645 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BMP3P12645 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BMP3P12645 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BMP3P12645 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BMP3P12645 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
BMP3P12645 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BMP3P12645 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BMP3P12645 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BMP3P12645 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BMP3P12645 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BMP3P12645 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BMP3P12645 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BMP3P12645 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BMP3P12645 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BMP3P12645 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BMP3P12645 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BMP3P12645 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
BMP3P12645 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BMP3P12645 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BMP3P12645 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BMP3P12645 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BMP3P12645 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BMP3P12645 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BMP3P12645 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BMP3P12645 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BMP3P12645 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BMP3P12645 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BMP3P12645 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
BMP3P12645 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BMP3P12645 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BMP3P12645 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BMP3P12645 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BMP3P12645 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BMP3P12645 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BMP3P12645 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BMP3P12645 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BMP3P12645 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BMP3P12645 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BMP3P12645 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BMP3P12645 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BMP3P12645 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BMP3P12645 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
BMP3P12645 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BMP3P12645 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BMP3P12645 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BMP3P12645 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BMP3P12645 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BMP3P12645 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BMP3P12645 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BMP3P12645 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BMP3P12645 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
BMP3P12645 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BMP3P12645 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BMP3P12645 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BMP3P12645 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BMP3P12645 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BMP3P12645 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BMP3P12645 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BMP3P12645 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BMP3P12645 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BMP3P12645 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BMP3P12645 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BMP3P12645 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BMP3P12645 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BMP3P12645 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BMP3P12645 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BMP3P12645 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BMP3P12645 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BMP3P12645 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BMP3P12645 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
BMP3P12645 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BMP3P12645 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
BMP3P12645 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BMP3P12645 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BMP3P12645 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BMP3P12645 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
BMP3P12645 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
BMP3P12645 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms