Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
POLR1AO95602 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
POLR1AO95602 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
POLR1AO95602 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
POLR1AO95602 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
POLR1AO95602 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
POLR1AO95602 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
POLR1AO95602 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
POLR1AO95602 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
POLR1AO95602 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
POLR1AO95602 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
POLR1AO95602 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
POLR1AO95602 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
POLR1AO95602 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
POLR1AO95602 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
POLR1AO95602 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
POLR1AO95602 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
POLR1AO95602 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
POLR1AO95602 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
POLR1AO95602 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
POLR1AO95602 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
POLR1AO95602 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
POLR1AO95602 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
POLR1AO95602 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
POLR1AO95602 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
POLR1AO95602 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
POLR1AO95602 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
POLR1AO95602 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
POLR1AO95602 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
POLR1AO95602 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
POLR1AO95602 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
POLR1AO95602 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
POLR1AO95602 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
POLR1AO95602 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
POLR1AO95602 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
POLR1AO95602 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
POLR1AO95602 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
POLR1AO95602 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
POLR1AO95602 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
POLR1AO95602 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
POLR1AO95602 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
POLR1AO95602 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
POLR1AO95602 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
POLR1AO95602 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
POLR1AO95602 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLR1AO95602 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLR1AO95602 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLR1AO95602 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLR1AO95602 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLR1AO95602 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLR1AO95602 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLR1AO95602 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLR1AO95602 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLR1AO95602 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
POLR1AO95602 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLR1AO95602 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLR1AO95602 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLR1AO95602 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLR1AO95602 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLR1AO95602 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLR1AO95602 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLR1AO95602 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
POLR1AO95602 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLR1AO95602 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLR1AO95602 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
POLR1AO95602 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLR1AO95602 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLR1AO95602 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
POLR1AO95602 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
POLR1AO95602 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLR1AO95602 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLR1AO95602 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLR1AO95602 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLR1AO95602 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLR1AO95602 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLR1AO95602 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLR1AO95602 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLR1AO95602 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLR1AO95602 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLR1AO95602 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
POLR1AO95602 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
POLR1AO95602 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLR1AO95602 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLR1AO95602 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLR1AO95602 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLR1AO95602 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLR1AO95602 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
POLR1AO95602 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
POLR1AO95602 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
POLR1AO95602 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
POLR1AO95602 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
POLR1AO95602 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
POLR1AO95602 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
POLR1AO95602 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
POLR1AO95602 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
POLR1AO95602 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
POLR1AO95602 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
POLR1AO95602 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
POLR1AO95602 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
POLR1AO95602 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms