Protein–RNA interactions for Protein: O75379

VAMP4, Vesicle-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP4O75379 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VAMP4O75379 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
VAMP4O75379 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VAMP4O75379 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VAMP4O75379 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VAMP4O75379 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VAMP4O75379 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VAMP4O75379 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VAMP4O75379 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VAMP4O75379 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VAMP4O75379 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VAMP4O75379 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VAMP4O75379 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VAMP4O75379 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VAMP4O75379 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VAMP4O75379 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VAMP4O75379 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VAMP4O75379 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VAMP4O75379 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VAMP4O75379 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VAMP4O75379 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VAMP4O75379 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
VAMP4O75379 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
VAMP4O75379 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
VAMP4O75379 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
VAMP4O75379 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
VAMP4O75379 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VAMP4O75379 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VAMP4O75379 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VAMP4O75379 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VAMP4O75379 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VAMP4O75379 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VAMP4O75379 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VAMP4O75379 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VAMP4O75379 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VAMP4O75379 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VAMP4O75379 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VAMP4O75379 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VAMP4O75379 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VAMP4O75379 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VAMP4O75379 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VAMP4O75379 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VAMP4O75379 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VAMP4O75379 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VAMP4O75379 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VAMP4O75379 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VAMP4O75379 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VAMP4O75379 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VAMP4O75379 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VAMP4O75379 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VAMP4O75379 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VAMP4O75379 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VAMP4O75379 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VAMP4O75379 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VAMP4O75379 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VAMP4O75379 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VAMP4O75379 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VAMP4O75379 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VAMP4O75379 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VAMP4O75379 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VAMP4O75379 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VAMP4O75379 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VAMP4O75379 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VAMP4O75379 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VAMP4O75379 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VAMP4O75379 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VAMP4O75379 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VAMP4O75379 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VAMP4O75379 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VAMP4O75379 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VAMP4O75379 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VAMP4O75379 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VAMP4O75379 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VAMP4O75379 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VAMP4O75379 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VAMP4O75379 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VAMP4O75379 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
VAMP4O75379 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VAMP4O75379 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
VAMP4O75379 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VAMP4O75379 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VAMP4O75379 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VAMP4O75379 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VAMP4O75379 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VAMP4O75379 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VAMP4O75379 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VAMP4O75379 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VAMP4O75379 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VAMP4O75379 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VAMP4O75379 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VAMP4O75379 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VAMP4O75379 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
VAMP4O75379 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
VAMP4O75379 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
VAMP4O75379 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
VAMP4O75379 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VAMP4O75379 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VAMP4O75379 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VAMP4O75379 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VAMP4O75379 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms