Protein–RNA interactions for Protein: O43426

SYNJ1, Synaptojanin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,573 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNJ1O43426 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SYNJ1O43426 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SYNJ1O43426 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SYNJ1O43426 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SYNJ1O43426 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SYNJ1O43426 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SYNJ1O43426 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
SYNJ1O43426 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SYNJ1O43426 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SYNJ1O43426 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
SYNJ1O43426 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SYNJ1O43426 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SYNJ1O43426 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SYNJ1O43426 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SYNJ1O43426 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SYNJ1O43426 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SYNJ1O43426 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SYNJ1O43426 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SYNJ1O43426 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
SYNJ1O43426 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SYNJ1O43426 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
SYNJ1O43426 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SYNJ1O43426 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SYNJ1O43426 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC29.26■■■□□ 2.28
SYNJ1O43426 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.28
SYNJ1O43426 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.28
SYNJ1O43426 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.28
SYNJ1O43426 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC29.26■■■□□ 2.28
SYNJ1O43426 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
SYNJ1O43426 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
SYNJ1O43426 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.28
SYNJ1O43426 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SYNJ1O43426 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SYNJ1O43426 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SYNJ1O43426 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SYNJ1O43426 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SYNJ1O43426 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SYNJ1O43426 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SYNJ1O43426 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SYNJ1O43426 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SYNJ1O43426 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SYNJ1O43426 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SYNJ1O43426 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SYNJ1O43426 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SYNJ1O43426 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SYNJ1O43426 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
SYNJ1O43426 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SYNJ1O43426 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SYNJ1O43426 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SYNJ1O43426 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
SYNJ1O43426 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SYNJ1O43426 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SYNJ1O43426 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SYNJ1O43426 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SYNJ1O43426 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SYNJ1O43426 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SYNJ1O43426 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SYNJ1O43426 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SYNJ1O43426 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SYNJ1O43426 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SYNJ1O43426 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SYNJ1O43426 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
SYNJ1O43426 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SYNJ1O43426 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
SYNJ1O43426 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SYNJ1O43426 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SYNJ1O43426 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SYNJ1O43426 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SYNJ1O43426 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SYNJ1O43426 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SYNJ1O43426 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SYNJ1O43426 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SYNJ1O43426 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SYNJ1O43426 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SYNJ1O43426 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SYNJ1O43426 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
SYNJ1O43426 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SYNJ1O43426 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SYNJ1O43426 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SYNJ1O43426 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SYNJ1O43426 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SYNJ1O43426 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SYNJ1O43426 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SYNJ1O43426 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SYNJ1O43426 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SYNJ1O43426 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SYNJ1O43426 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SYNJ1O43426 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
SYNJ1O43426 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
SYNJ1O43426 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SYNJ1O43426 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SYNJ1O43426 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SYNJ1O43426 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SYNJ1O43426 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
SYNJ1O43426 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SYNJ1O43426 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SYNJ1O43426 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SYNJ1O43426 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SYNJ1O43426 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SYNJ1O43426 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms