Protein–RNA interactions for Protein: O15205

UBD, Ubiquitin D, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBDO15205 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBDO15205 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
UBDO15205 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBDO15205 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBDO15205 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBDO15205 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBDO15205 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBDO15205 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBDO15205 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBDO15205 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBDO15205 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBDO15205 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBDO15205 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBDO15205 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBDO15205 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
UBDO15205 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBDO15205 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBDO15205 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBDO15205 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
UBDO15205 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
UBDO15205 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
UBDO15205 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
UBDO15205 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
UBDO15205 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
UBDO15205 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
UBDO15205 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
UBDO15205 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
UBDO15205 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
UBDO15205 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
UBDO15205 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBDO15205 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBDO15205 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBDO15205 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBDO15205 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBDO15205 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBDO15205 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBDO15205 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
UBDO15205 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBDO15205 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBDO15205 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
UBDO15205 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBDO15205 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBDO15205 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBDO15205 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
UBDO15205 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBDO15205 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBDO15205 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBDO15205 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBDO15205 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBDO15205 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBDO15205 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBDO15205 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBDO15205 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBDO15205 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBDO15205 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBDO15205 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBDO15205 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBDO15205 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBDO15205 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBDO15205 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBDO15205 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBDO15205 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBDO15205 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBDO15205 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBDO15205 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBDO15205 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBDO15205 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBDO15205 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBDO15205 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBDO15205 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBDO15205 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBDO15205 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
UBDO15205 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBDO15205 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBDO15205 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBDO15205 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBDO15205 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBDO15205 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBDO15205 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBDO15205 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
UBDO15205 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBDO15205 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBDO15205 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBDO15205 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBDO15205 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBDO15205 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBDO15205 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBDO15205 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBDO15205 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBDO15205 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBDO15205 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBDO15205 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBDO15205 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBDO15205 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
UBDO15205 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UBDO15205 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
UBDO15205 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
UBDO15205 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
UBDO15205 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UBDO15205 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms