Protein–RNA interactions for Protein: O15084

ANKRD28, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28O15084 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD28O15084 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms