Protein–RNA interactions for Protein: O15056

SYNJ2, Synaptojanin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,496 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNJ2O15056 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SYNJ2O15056 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
SYNJ2O15056 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SYNJ2O15056 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SYNJ2O15056 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SYNJ2O15056 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SYNJ2O15056 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SYNJ2O15056 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SYNJ2O15056 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SYNJ2O15056 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SYNJ2O15056 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
SYNJ2O15056 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SYNJ2O15056 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SYNJ2O15056 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SYNJ2O15056 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SYNJ2O15056 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SYNJ2O15056 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SYNJ2O15056 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SYNJ2O15056 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SYNJ2O15056 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SYNJ2O15056 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SYNJ2O15056 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SYNJ2O15056 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SYNJ2O15056 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SYNJ2O15056 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
SYNJ2O15056 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SYNJ2O15056 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SYNJ2O15056 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SYNJ2O15056 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SYNJ2O15056 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SYNJ2O15056 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SYNJ2O15056 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SYNJ2O15056 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SYNJ2O15056 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SYNJ2O15056 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SYNJ2O15056 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SYNJ2O15056 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SYNJ2O15056 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SYNJ2O15056 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SYNJ2O15056 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SYNJ2O15056 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SYNJ2O15056 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
SYNJ2O15056 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SYNJ2O15056 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SYNJ2O15056 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SYNJ2O15056 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SYNJ2O15056 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SYNJ2O15056 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SYNJ2O15056 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SYNJ2O15056 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SYNJ2O15056 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SYNJ2O15056 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SYNJ2O15056 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SYNJ2O15056 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SYNJ2O15056 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SYNJ2O15056 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SYNJ2O15056 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
SYNJ2O15056 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SYNJ2O15056 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SYNJ2O15056 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SYNJ2O15056 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SYNJ2O15056 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SYNJ2O15056 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SYNJ2O15056 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SYNJ2O15056 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SYNJ2O15056 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SYNJ2O15056 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
SYNJ2O15056 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SYNJ2O15056 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SYNJ2O15056 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SYNJ2O15056 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SYNJ2O15056 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SYNJ2O15056 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SYNJ2O15056 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SYNJ2O15056 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SYNJ2O15056 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SYNJ2O15056 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
SYNJ2O15056 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SYNJ2O15056 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SYNJ2O15056 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SYNJ2O15056 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SYNJ2O15056 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
SYNJ2O15056 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SYNJ2O15056 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
SYNJ2O15056 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SYNJ2O15056 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SYNJ2O15056 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SYNJ2O15056 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SYNJ2O15056 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SYNJ2O15056 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SYNJ2O15056 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SYNJ2O15056 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SYNJ2O15056 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
SYNJ2O15056 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SYNJ2O15056 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SYNJ2O15056 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SYNJ2O15056 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
SYNJ2O15056 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SYNJ2O15056 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
SYNJ2O15056 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms