Protein–RNA interactions for Protein: O00468

AGRN, Agrin, humanhuman

Predictions only

Length 2,067 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGRNO00468 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
AGRNO00468 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
AGRNO00468 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
AGRNO00468 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
AGRNO00468 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
AGRNO00468 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
AGRNO00468 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
AGRNO00468 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
AGRNO00468 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
AGRNO00468 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
AGRNO00468 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
AGRNO00468 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
AGRNO00468 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
AGRNO00468 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
AGRNO00468 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC13.24□□□□□ -0.29
AGRNO00468 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
AGRNO00468 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC13.24□□□□□ -0.29
AGRNO00468 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
AGRNO00468 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
AGRNO00468 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
AGRNO00468 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
AGRNO00468 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
AGRNO00468 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
AGRNO00468 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
AGRNO00468 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
AGRNO00468 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
AGRNO00468 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
AGRNO00468 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
AGRNO00468 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
AGRNO00468 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
AGRNO00468 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
AGRNO00468 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
AGRNO00468 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
AGRNO00468 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
AGRNO00468 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
AGRNO00468 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
AGRNO00468 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
AGRNO00468 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
AGRNO00468 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
AGRNO00468 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
AGRNO00468 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
AGRNO00468 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
AGRNO00468 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC13.24□□□□□ -0.29
AGRNO00468 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
AGRNO00468 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC13.24□□□□□ -0.29
AGRNO00468 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
AGRNO00468 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
AGRNO00468 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
AGRNO00468 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
AGRNO00468 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
AGRNO00468 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
AGRNO00468 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
AGRNO00468 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
AGRNO00468 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
AGRNO00468 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
AGRNO00468 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
AGRNO00468 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
AGRNO00468 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
AGRNO00468 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
AGRNO00468 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
AGRNO00468 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
AGRNO00468 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
AGRNO00468 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
AGRNO00468 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
AGRNO00468 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
AGRNO00468 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
AGRNO00468 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
AGRNO00468 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
AGRNO00468 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
AGRNO00468 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
AGRNO00468 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
AGRNO00468 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
AGRNO00468 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
AGRNO00468 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
AGRNO00468 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
AGRNO00468 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
AGRNO00468 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
AGRNO00468 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
AGRNO00468 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
AGRNO00468 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
AGRNO00468 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
AGRNO00468 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
AGRNO00468 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
AGRNO00468 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
AGRNO00468 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
AGRNO00468 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
AGRNO00468 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
AGRNO00468 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
AGRNO00468 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
AGRNO00468 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
AGRNO00468 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
AGRNO00468 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
AGRNO00468 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
AGRNO00468 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
AGRNO00468 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
AGRNO00468 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
AGRNO00468 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
AGRNO00468 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
AGRNO00468 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
AGRNO00468 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
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