Protein–RNA interactions for Protein: O00399

DCTN6, Dynactin subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN6O00399 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DCTN6O00399 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DCTN6O00399 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DCTN6O00399 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DCTN6O00399 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
DCTN6O00399 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DCTN6O00399 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DCTN6O00399 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DCTN6O00399 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DCTN6O00399 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DCTN6O00399 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DCTN6O00399 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DCTN6O00399 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DCTN6O00399 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DCTN6O00399 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DCTN6O00399 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCTN6O00399 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCTN6O00399 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCTN6O00399 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCTN6O00399 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCTN6O00399 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCTN6O00399 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCTN6O00399 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCTN6O00399 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCTN6O00399 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCTN6O00399 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCTN6O00399 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCTN6O00399 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCTN6O00399 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCTN6O00399 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCTN6O00399 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
DCTN6O00399 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCTN6O00399 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCTN6O00399 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCTN6O00399 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCTN6O00399 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCTN6O00399 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
DCTN6O00399 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCTN6O00399 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCTN6O00399 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCTN6O00399 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCTN6O00399 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCTN6O00399 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCTN6O00399 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCTN6O00399 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCTN6O00399 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCTN6O00399 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCTN6O00399 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCTN6O00399 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCTN6O00399 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DCTN6O00399 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DCTN6O00399 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DCTN6O00399 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DCTN6O00399 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DCTN6O00399 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DCTN6O00399 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DCTN6O00399 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DCTN6O00399 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DCTN6O00399 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DCTN6O00399 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DCTN6O00399 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DCTN6O00399 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DCTN6O00399 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DCTN6O00399 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DCTN6O00399 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DCTN6O00399 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
DCTN6O00399 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
DCTN6O00399 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DCTN6O00399 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DCTN6O00399 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DCTN6O00399 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DCTN6O00399 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DCTN6O00399 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DCTN6O00399 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DCTN6O00399 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DCTN6O00399 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DCTN6O00399 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
DCTN6O00399 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DCTN6O00399 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DCTN6O00399 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
DCTN6O00399 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DCTN6O00399 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCTN6O00399 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCTN6O00399 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCTN6O00399 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCTN6O00399 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCTN6O00399 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
DCTN6O00399 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCTN6O00399 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCTN6O00399 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCTN6O00399 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCTN6O00399 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCTN6O00399 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCTN6O00399 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCTN6O00399 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCTN6O00399 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCTN6O00399 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCTN6O00399 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCTN6O00399 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCTN6O00399 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms