Protein–RNA interactions for Protein: H7C1D1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C1D1 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
H7C1D1 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
H7C1D1 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
H7C1D1 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
H7C1D1 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
H7C1D1 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
H7C1D1 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
H7C1D1 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
H7C1D1 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
H7C1D1 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
H7C1D1 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
H7C1D1 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
H7C1D1 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
H7C1D1 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
H7C1D1 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
H7C1D1 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
H7C1D1 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
H7C1D1 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
H7C1D1 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
H7C1D1 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
H7C1D1 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
H7C1D1 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
H7C1D1 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
H7C1D1 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
H7C1D1 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
H7C1D1 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
H7C1D1 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
H7C1D1 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
H7C1D1 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
H7C1D1 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
H7C1D1 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
H7C1D1 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
H7C1D1 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
H7C1D1 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
H7C1D1 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
H7C1D1 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
H7C1D1 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
H7C1D1 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
H7C1D1 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
H7C1D1 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
H7C1D1 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
H7C1D1 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
H7C1D1 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
H7C1D1 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
H7C1D1 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
H7C1D1 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
H7C1D1 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
H7C1D1 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
H7C1D1 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
H7C1D1 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
H7C1D1 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
H7C1D1 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
H7C1D1 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
H7C1D1 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
H7C1D1 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
H7C1D1 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
H7C1D1 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
H7C1D1 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
H7C1D1 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
H7C1D1 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
H7C1D1 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
H7C1D1 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
H7C1D1 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
H7C1D1 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
H7C1D1 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
H7C1D1 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
H7C1D1 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
H7C1D1 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
H7C1D1 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
H7C1D1 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
H7C1D1 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
H7C1D1 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
H7C1D1 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
H7C1D1 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
H7C1D1 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
H7C1D1 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
H7C1D1 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
H7C1D1 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
H7C1D1 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
H7C1D1 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
H7C1D1 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
H7C1D1 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
H7C1D1 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
H7C1D1 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
H7C1D1 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
H7C1D1 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
H7C1D1 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
H7C1D1 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
H7C1D1 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
H7C1D1 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
H7C1D1 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
H7C1D1 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
H7C1D1 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
H7C1D1 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
H7C1D1 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
H7C1D1 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
H7C1D1 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
H7C1D1 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
H7C1D1 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
H7C1D1 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms