Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms