Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 SFRP1-202ENST00000379845 3873 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 DLG4-203ENST00000399510 3975 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 TNPO2-218ENST00000592287 2914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC13.31□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
LINC00587B1AMM8 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms