Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSDA5PKW4 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSDA5PKW4 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSDA5PKW4 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSDA5PKW4 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSDA5PKW4 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PSDA5PKW4 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSDA5PKW4 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSDA5PKW4 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSDA5PKW4 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSDA5PKW4 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PSDA5PKW4 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PSDA5PKW4 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSDA5PKW4 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSDA5PKW4 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSDA5PKW4 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSDA5PKW4 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSDA5PKW4 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSDA5PKW4 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PSDA5PKW4 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PSDA5PKW4 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSDA5PKW4 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSDA5PKW4 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSDA5PKW4 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PSDA5PKW4 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSDA5PKW4 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSDA5PKW4 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSDA5PKW4 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSDA5PKW4 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSDA5PKW4 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSDA5PKW4 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSDA5PKW4 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSDA5PKW4 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSDA5PKW4 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PSDA5PKW4 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSDA5PKW4 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSDA5PKW4 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSDA5PKW4 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSDA5PKW4 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PSDA5PKW4 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSDA5PKW4 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PSDA5PKW4 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PSDA5PKW4 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSDA5PKW4 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSDA5PKW4 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSDA5PKW4 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSDA5PKW4 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSDA5PKW4 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSDA5PKW4 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSDA5PKW4 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSDA5PKW4 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSDA5PKW4 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSDA5PKW4 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSDA5PKW4 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSDA5PKW4 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSDA5PKW4 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSDA5PKW4 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSDA5PKW4 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSDA5PKW4 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSDA5PKW4 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSDA5PKW4 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSDA5PKW4 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSDA5PKW4 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSDA5PKW4 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSDA5PKW4 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSDA5PKW4 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSDA5PKW4 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSDA5PKW4 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSDA5PKW4 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSDA5PKW4 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSDA5PKW4 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSDA5PKW4 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSDA5PKW4 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSDA5PKW4 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSDA5PKW4 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSDA5PKW4 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PSDA5PKW4 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PSDA5PKW4 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PSDA5PKW4 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSDA5PKW4 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSDA5PKW4 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSDA5PKW4 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSDA5PKW4 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSDA5PKW4 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSDA5PKW4 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSDA5PKW4 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSDA5PKW4 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSDA5PKW4 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PSDA5PKW4 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSDA5PKW4 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSDA5PKW4 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSDA5PKW4 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSDA5PKW4 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSDA5PKW4 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSDA5PKW4 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSDA5PKW4 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSDA5PKW4 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSDA5PKW4 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSDA5PKW4 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSDA5PKW4 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms