Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Q9

GTF3C3, General transcription factor 3C polypeptide 3, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C3Q9Y5Q9 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GTF3C3Q9Y5Q9 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GTF3C3Q9Y5Q9 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GTF3C3Q9Y5Q9 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GTF3C3Q9Y5Q9 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GTF3C3Q9Y5Q9 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GTF3C3Q9Y5Q9 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GTF3C3Q9Y5Q9 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
GTF3C3Q9Y5Q9 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GTF3C3Q9Y5Q9 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GTF3C3Q9Y5Q9 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
GTF3C3Q9Y5Q9 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GTF3C3Q9Y5Q9 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
GTF3C3Q9Y5Q9 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GTF3C3Q9Y5Q9 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GTF3C3Q9Y5Q9 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GTF3C3Q9Y5Q9 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GTF3C3Q9Y5Q9 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GTF3C3Q9Y5Q9 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GTF3C3Q9Y5Q9 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GTF3C3Q9Y5Q9 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GTF3C3Q9Y5Q9 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GTF3C3Q9Y5Q9 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GTF3C3Q9Y5Q9 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GTF3C3Q9Y5Q9 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GTF3C3Q9Y5Q9 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GTF3C3Q9Y5Q9 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GTF3C3Q9Y5Q9 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
GTF3C3Q9Y5Q9 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GTF3C3Q9Y5Q9 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GTF3C3Q9Y5Q9 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GTF3C3Q9Y5Q9 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GTF3C3Q9Y5Q9 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GTF3C3Q9Y5Q9 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
GTF3C3Q9Y5Q9 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GTF3C3Q9Y5Q9 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GTF3C3Q9Y5Q9 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GTF3C3Q9Y5Q9 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GTF3C3Q9Y5Q9 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GTF3C3Q9Y5Q9 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GTF3C3Q9Y5Q9 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GTF3C3Q9Y5Q9 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GTF3C3Q9Y5Q9 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GTF3C3Q9Y5Q9 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GTF3C3Q9Y5Q9 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GTF3C3Q9Y5Q9 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GTF3C3Q9Y5Q9 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GTF3C3Q9Y5Q9 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GTF3C3Q9Y5Q9 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GTF3C3Q9Y5Q9 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GTF3C3Q9Y5Q9 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GTF3C3Q9Y5Q9 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GTF3C3Q9Y5Q9 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GTF3C3Q9Y5Q9 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GTF3C3Q9Y5Q9 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GTF3C3Q9Y5Q9 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GTF3C3Q9Y5Q9 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GTF3C3Q9Y5Q9 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GTF3C3Q9Y5Q9 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GTF3C3Q9Y5Q9 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GTF3C3Q9Y5Q9 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GTF3C3Q9Y5Q9 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
GTF3C3Q9Y5Q9 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GTF3C3Q9Y5Q9 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GTF3C3Q9Y5Q9 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GTF3C3Q9Y5Q9 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GTF3C3Q9Y5Q9 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GTF3C3Q9Y5Q9 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GTF3C3Q9Y5Q9 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GTF3C3Q9Y5Q9 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GTF3C3Q9Y5Q9 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GTF3C3Q9Y5Q9 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GTF3C3Q9Y5Q9 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GTF3C3Q9Y5Q9 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GTF3C3Q9Y5Q9 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GTF3C3Q9Y5Q9 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GTF3C3Q9Y5Q9 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GTF3C3Q9Y5Q9 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GTF3C3Q9Y5Q9 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GTF3C3Q9Y5Q9 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GTF3C3Q9Y5Q9 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GTF3C3Q9Y5Q9 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GTF3C3Q9Y5Q9 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GTF3C3Q9Y5Q9 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GTF3C3Q9Y5Q9 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GTF3C3Q9Y5Q9 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GTF3C3Q9Y5Q9 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GTF3C3Q9Y5Q9 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GTF3C3Q9Y5Q9 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GTF3C3Q9Y5Q9 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GTF3C3Q9Y5Q9 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GTF3C3Q9Y5Q9 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GTF3C3Q9Y5Q9 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GTF3C3Q9Y5Q9 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GTF3C3Q9Y5Q9 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GTF3C3Q9Y5Q9 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms