Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN81

L1RE1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1RE1Q9UN81 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
L1RE1Q9UN81 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
L1RE1Q9UN81 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
L1RE1Q9UN81 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
L1RE1Q9UN81 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
L1RE1Q9UN81 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
L1RE1Q9UN81 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
L1RE1Q9UN81 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
L1RE1Q9UN81 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
L1RE1Q9UN81 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
L1RE1Q9UN81 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
L1RE1Q9UN81 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
L1RE1Q9UN81 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
L1RE1Q9UN81 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
L1RE1Q9UN81 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
L1RE1Q9UN81 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
L1RE1Q9UN81 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
L1RE1Q9UN81 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
L1RE1Q9UN81 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
L1RE1Q9UN81 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
L1RE1Q9UN81 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
L1RE1Q9UN81 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
L1RE1Q9UN81 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
L1RE1Q9UN81 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
L1RE1Q9UN81 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
L1RE1Q9UN81 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
L1RE1Q9UN81 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
L1RE1Q9UN81 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
L1RE1Q9UN81 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
L1RE1Q9UN81 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
L1RE1Q9UN81 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
L1RE1Q9UN81 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
L1RE1Q9UN81 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
L1RE1Q9UN81 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
L1RE1Q9UN81 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
L1RE1Q9UN81 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
L1RE1Q9UN81 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
L1RE1Q9UN81 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
L1RE1Q9UN81 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
L1RE1Q9UN81 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
L1RE1Q9UN81 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
L1RE1Q9UN81 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
L1RE1Q9UN81 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
L1RE1Q9UN81 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
L1RE1Q9UN81 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
L1RE1Q9UN81 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
L1RE1Q9UN81 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
L1RE1Q9UN81 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
L1RE1Q9UN81 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
L1RE1Q9UN81 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
L1RE1Q9UN81 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
L1RE1Q9UN81 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
L1RE1Q9UN81 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
L1RE1Q9UN81 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
L1RE1Q9UN81 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
L1RE1Q9UN81 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
L1RE1Q9UN81 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
L1RE1Q9UN81 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
L1RE1Q9UN81 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
L1RE1Q9UN81 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
L1RE1Q9UN81 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
L1RE1Q9UN81 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
L1RE1Q9UN81 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
L1RE1Q9UN81 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
L1RE1Q9UN81 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
L1RE1Q9UN81 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
L1RE1Q9UN81 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
L1RE1Q9UN81 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
L1RE1Q9UN81 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
L1RE1Q9UN81 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
L1RE1Q9UN81 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
L1RE1Q9UN81 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
L1RE1Q9UN81 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
L1RE1Q9UN81 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
L1RE1Q9UN81 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
L1RE1Q9UN81 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
L1RE1Q9UN81 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
L1RE1Q9UN81 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
L1RE1Q9UN81 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
L1RE1Q9UN81 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
L1RE1Q9UN81 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
L1RE1Q9UN81 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
L1RE1Q9UN81 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
L1RE1Q9UN81 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
L1RE1Q9UN81 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
L1RE1Q9UN81 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
L1RE1Q9UN81 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
L1RE1Q9UN81 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
L1RE1Q9UN81 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
L1RE1Q9UN81 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
L1RE1Q9UN81 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
L1RE1Q9UN81 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
L1RE1Q9UN81 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
L1RE1Q9UN81 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
L1RE1Q9UN81 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
L1RE1Q9UN81 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
L1RE1Q9UN81 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
L1RE1Q9UN81 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
L1RE1Q9UN81 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
L1RE1Q9UN81 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms