Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM44

HHLA2, HERV-H LTR-associating protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA2Q9UM44 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HHLA2Q9UM44 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HHLA2Q9UM44 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HHLA2Q9UM44 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HHLA2Q9UM44 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HHLA2Q9UM44 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HHLA2Q9UM44 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HHLA2Q9UM44 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HHLA2Q9UM44 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HHLA2Q9UM44 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HHLA2Q9UM44 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HHLA2Q9UM44 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HHLA2Q9UM44 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HHLA2Q9UM44 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HHLA2Q9UM44 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HHLA2Q9UM44 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HHLA2Q9UM44 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HHLA2Q9UM44 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HHLA2Q9UM44 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HHLA2Q9UM44 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HHLA2Q9UM44 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HHLA2Q9UM44 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HHLA2Q9UM44 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HHLA2Q9UM44 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HHLA2Q9UM44 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HHLA2Q9UM44 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HHLA2Q9UM44 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HHLA2Q9UM44 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HHLA2Q9UM44 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HHLA2Q9UM44 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HHLA2Q9UM44 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HHLA2Q9UM44 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HHLA2Q9UM44 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HHLA2Q9UM44 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HHLA2Q9UM44 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HHLA2Q9UM44 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HHLA2Q9UM44 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HHLA2Q9UM44 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HHLA2Q9UM44 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HHLA2Q9UM44 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms