Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULS5

TMCC3, Transmembrane and coiled-coil domain protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCC3Q9ULS5 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMCC3Q9ULS5 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMCC3Q9ULS5 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMCC3Q9ULS5 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMCC3Q9ULS5 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMCC3Q9ULS5 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMCC3Q9ULS5 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMCC3Q9ULS5 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TMCC3Q9ULS5 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMCC3Q9ULS5 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMCC3Q9ULS5 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TMCC3Q9ULS5 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMCC3Q9ULS5 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMCC3Q9ULS5 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMCC3Q9ULS5 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMCC3Q9ULS5 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMCC3Q9ULS5 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMCC3Q9ULS5 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMCC3Q9ULS5 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMCC3Q9ULS5 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMCC3Q9ULS5 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMCC3Q9ULS5 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMCC3Q9ULS5 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMCC3Q9ULS5 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMCC3Q9ULS5 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMCC3Q9ULS5 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMCC3Q9ULS5 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TMCC3Q9ULS5 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMCC3Q9ULS5 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMCC3Q9ULS5 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMCC3Q9ULS5 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMCC3Q9ULS5 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMCC3Q9ULS5 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMCC3Q9ULS5 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMCC3Q9ULS5 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMCC3Q9ULS5 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMCC3Q9ULS5 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMCC3Q9ULS5 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMCC3Q9ULS5 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMCC3Q9ULS5 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMCC3Q9ULS5 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TMCC3Q9ULS5 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TMCC3Q9ULS5 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TMCC3Q9ULS5 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TMCC3Q9ULS5 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMCC3Q9ULS5 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMCC3Q9ULS5 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMCC3Q9ULS5 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMCC3Q9ULS5 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMCC3Q9ULS5 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMCC3Q9ULS5 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMCC3Q9ULS5 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMCC3Q9ULS5 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMCC3Q9ULS5 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMCC3Q9ULS5 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMCC3Q9ULS5 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMCC3Q9ULS5 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMCC3Q9ULS5 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMCC3Q9ULS5 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMCC3Q9ULS5 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMCC3Q9ULS5 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMCC3Q9ULS5 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMCC3Q9ULS5 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMCC3Q9ULS5 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMCC3Q9ULS5 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMCC3Q9ULS5 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMCC3Q9ULS5 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMCC3Q9ULS5 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMCC3Q9ULS5 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMCC3Q9ULS5 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMCC3Q9ULS5 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMCC3Q9ULS5 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMCC3Q9ULS5 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMCC3Q9ULS5 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMCC3Q9ULS5 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMCC3Q9ULS5 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TMCC3Q9ULS5 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMCC3Q9ULS5 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMCC3Q9ULS5 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMCC3Q9ULS5 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMCC3Q9ULS5 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMCC3Q9ULS5 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMCC3Q9ULS5 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMCC3Q9ULS5 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMCC3Q9ULS5 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMCC3Q9ULS5 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMCC3Q9ULS5 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMCC3Q9ULS5 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMCC3Q9ULS5 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMCC3Q9ULS5 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMCC3Q9ULS5 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMCC3Q9ULS5 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMCC3Q9ULS5 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMCC3Q9ULS5 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMCC3Q9ULS5 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMCC3Q9ULS5 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMCC3Q9ULS5 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMCC3Q9ULS5 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMCC3Q9ULS5 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMCC3Q9ULS5 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms