Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKD1

GMEB2, Glucocorticoid modulatory element-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMEB2Q9UKD1 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GMEB2Q9UKD1 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GMEB2Q9UKD1 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GMEB2Q9UKD1 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GMEB2Q9UKD1 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GMEB2Q9UKD1 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GMEB2Q9UKD1 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GMEB2Q9UKD1 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GMEB2Q9UKD1 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GMEB2Q9UKD1 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GMEB2Q9UKD1 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GMEB2Q9UKD1 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GMEB2Q9UKD1 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GMEB2Q9UKD1 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GMEB2Q9UKD1 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GMEB2Q9UKD1 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
GMEB2Q9UKD1 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GMEB2Q9UKD1 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GMEB2Q9UKD1 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
GMEB2Q9UKD1 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GMEB2Q9UKD1 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GMEB2Q9UKD1 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GMEB2Q9UKD1 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
GMEB2Q9UKD1 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
GMEB2Q9UKD1 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GMEB2Q9UKD1 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GMEB2Q9UKD1 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GMEB2Q9UKD1 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GMEB2Q9UKD1 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GMEB2Q9UKD1 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GMEB2Q9UKD1 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GMEB2Q9UKD1 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
GMEB2Q9UKD1 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GMEB2Q9UKD1 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GMEB2Q9UKD1 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GMEB2Q9UKD1 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GMEB2Q9UKD1 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GMEB2Q9UKD1 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GMEB2Q9UKD1 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GMEB2Q9UKD1 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GMEB2Q9UKD1 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GMEB2Q9UKD1 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GMEB2Q9UKD1 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GMEB2Q9UKD1 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GMEB2Q9UKD1 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GMEB2Q9UKD1 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GMEB2Q9UKD1 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GMEB2Q9UKD1 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GMEB2Q9UKD1 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GMEB2Q9UKD1 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GMEB2Q9UKD1 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GMEB2Q9UKD1 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GMEB2Q9UKD1 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
GMEB2Q9UKD1 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GMEB2Q9UKD1 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GMEB2Q9UKD1 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GMEB2Q9UKD1 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GMEB2Q9UKD1 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
GMEB2Q9UKD1 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
GMEB2Q9UKD1 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
GMEB2Q9UKD1 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GMEB2Q9UKD1 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GMEB2Q9UKD1 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GMEB2Q9UKD1 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GMEB2Q9UKD1 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GMEB2Q9UKD1 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GMEB2Q9UKD1 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GMEB2Q9UKD1 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GMEB2Q9UKD1 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GMEB2Q9UKD1 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GMEB2Q9UKD1 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GMEB2Q9UKD1 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GMEB2Q9UKD1 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GMEB2Q9UKD1 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GMEB2Q9UKD1 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GMEB2Q9UKD1 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GMEB2Q9UKD1 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GMEB2Q9UKD1 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GMEB2Q9UKD1 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GMEB2Q9UKD1 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GMEB2Q9UKD1 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GMEB2Q9UKD1 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GMEB2Q9UKD1 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GMEB2Q9UKD1 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GMEB2Q9UKD1 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GMEB2Q9UKD1 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GMEB2Q9UKD1 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GMEB2Q9UKD1 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GMEB2Q9UKD1 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GMEB2Q9UKD1 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GMEB2Q9UKD1 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GMEB2Q9UKD1 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GMEB2Q9UKD1 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GMEB2Q9UKD1 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GMEB2Q9UKD1 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GMEB2Q9UKD1 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GMEB2Q9UKD1 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GMEB2Q9UKD1 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GMEB2Q9UKD1 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GMEB2Q9UKD1 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms