Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIV1

CNOT7, CCR4-NOT transcription complex subunit 7, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT7Q9UIV1 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CNOT7Q9UIV1 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CNOT7Q9UIV1 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CNOT7Q9UIV1 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CNOT7Q9UIV1 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CNOT7Q9UIV1 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CNOT7Q9UIV1 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CNOT7Q9UIV1 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CNOT7Q9UIV1 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CNOT7Q9UIV1 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CNOT7Q9UIV1 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CNOT7Q9UIV1 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CNOT7Q9UIV1 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CNOT7Q9UIV1 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CNOT7Q9UIV1 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CNOT7Q9UIV1 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CNOT7Q9UIV1 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CNOT7Q9UIV1 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CNOT7Q9UIV1 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CNOT7Q9UIV1 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CNOT7Q9UIV1 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CNOT7Q9UIV1 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CNOT7Q9UIV1 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CNOT7Q9UIV1 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CNOT7Q9UIV1 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CNOT7Q9UIV1 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CNOT7Q9UIV1 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CNOT7Q9UIV1 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CNOT7Q9UIV1 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CNOT7Q9UIV1 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CNOT7Q9UIV1 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CNOT7Q9UIV1 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CNOT7Q9UIV1 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CNOT7Q9UIV1 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CNOT7Q9UIV1 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CNOT7Q9UIV1 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CNOT7Q9UIV1 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CNOT7Q9UIV1 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CNOT7Q9UIV1 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CNOT7Q9UIV1 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CNOT7Q9UIV1 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CNOT7Q9UIV1 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CNOT7Q9UIV1 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CNOT7Q9UIV1 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CNOT7Q9UIV1 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CNOT7Q9UIV1 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CNOT7Q9UIV1 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CNOT7Q9UIV1 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CNOT7Q9UIV1 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CNOT7Q9UIV1 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CNOT7Q9UIV1 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CNOT7Q9UIV1 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CNOT7Q9UIV1 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CNOT7Q9UIV1 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CNOT7Q9UIV1 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CNOT7Q9UIV1 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CNOT7Q9UIV1 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CNOT7Q9UIV1 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CNOT7Q9UIV1 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CNOT7Q9UIV1 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CNOT7Q9UIV1 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CNOT7Q9UIV1 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CNOT7Q9UIV1 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CNOT7Q9UIV1 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CNOT7Q9UIV1 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CNOT7Q9UIV1 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CNOT7Q9UIV1 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CNOT7Q9UIV1 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CNOT7Q9UIV1 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CNOT7Q9UIV1 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CNOT7Q9UIV1 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CNOT7Q9UIV1 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CNOT7Q9UIV1 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CNOT7Q9UIV1 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CNOT7Q9UIV1 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CNOT7Q9UIV1 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CNOT7Q9UIV1 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CNOT7Q9UIV1 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CNOT7Q9UIV1 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CNOT7Q9UIV1 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CNOT7Q9UIV1 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CNOT7Q9UIV1 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CNOT7Q9UIV1 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CNOT7Q9UIV1 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CNOT7Q9UIV1 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CNOT7Q9UIV1 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CNOT7Q9UIV1 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CNOT7Q9UIV1 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CNOT7Q9UIV1 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CNOT7Q9UIV1 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CNOT7Q9UIV1 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CNOT7Q9UIV1 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CNOT7Q9UIV1 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CNOT7Q9UIV1 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CNOT7Q9UIV1 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CNOT7Q9UIV1 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CNOT7Q9UIV1 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CNOT7Q9UIV1 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CNOT7Q9UIV1 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CNOT7Q9UIV1 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms