Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD9

UBQLN2, Ubiquilin-2, humanhuman

Predictions only

Length 624 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBQLN2Q9UHD9 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBQLN2Q9UHD9 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBQLN2Q9UHD9 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
UBQLN2Q9UHD9 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBQLN2Q9UHD9 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBQLN2Q9UHD9 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBQLN2Q9UHD9 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBQLN2Q9UHD9 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBQLN2Q9UHD9 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBQLN2Q9UHD9 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBQLN2Q9UHD9 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBQLN2Q9UHD9 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
UBQLN2Q9UHD9 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBQLN2Q9UHD9 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBQLN2Q9UHD9 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBQLN2Q9UHD9 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
UBQLN2Q9UHD9 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBQLN2Q9UHD9 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBQLN2Q9UHD9 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBQLN2Q9UHD9 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBQLN2Q9UHD9 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBQLN2Q9UHD9 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBQLN2Q9UHD9 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBQLN2Q9UHD9 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBQLN2Q9UHD9 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBQLN2Q9UHD9 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
UBQLN2Q9UHD9 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms