Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG63

ABCF2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF2Q9UG63 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ABCF2Q9UG63 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ABCF2Q9UG63 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ABCF2Q9UG63 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ABCF2Q9UG63 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ABCF2Q9UG63 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ABCF2Q9UG63 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ABCF2Q9UG63 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms