Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBY8

CLN8, Protein CLN8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8Q9UBY8 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLN8Q9UBY8 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLN8Q9UBY8 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLN8Q9UBY8 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLN8Q9UBY8 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLN8Q9UBY8 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CLN8Q9UBY8 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLN8Q9UBY8 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLN8Q9UBY8 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLN8Q9UBY8 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLN8Q9UBY8 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLN8Q9UBY8 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLN8Q9UBY8 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLN8Q9UBY8 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLN8Q9UBY8 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLN8Q9UBY8 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLN8Q9UBY8 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLN8Q9UBY8 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLN8Q9UBY8 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLN8Q9UBY8 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLN8Q9UBY8 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLN8Q9UBY8 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CLN8Q9UBY8 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CLN8Q9UBY8 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLN8Q9UBY8 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CLN8Q9UBY8 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLN8Q9UBY8 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLN8Q9UBY8 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLN8Q9UBY8 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLN8Q9UBY8 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLN8Q9UBY8 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLN8Q9UBY8 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLN8Q9UBY8 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLN8Q9UBY8 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLN8Q9UBY8 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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CLN8Q9UBY8 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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CLN8Q9UBY8 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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CLN8Q9UBY8 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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CLN8Q9UBY8 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLN8Q9UBY8 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
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