Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ0

VPS29, Vacuolar protein sorting-associated protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS29Q9UBQ0 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
VPS29Q9UBQ0 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
VPS29Q9UBQ0 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
VPS29Q9UBQ0 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VPS29Q9UBQ0 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
VPS29Q9UBQ0 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VPS29Q9UBQ0 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
VPS29Q9UBQ0 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VPS29Q9UBQ0 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
VPS29Q9UBQ0 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
VPS29Q9UBQ0 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VPS29Q9UBQ0 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
VPS29Q9UBQ0 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
VPS29Q9UBQ0 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
VPS29Q9UBQ0 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VPS29Q9UBQ0 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VPS29Q9UBQ0 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VPS29Q9UBQ0 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VPS29Q9UBQ0 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
VPS29Q9UBQ0 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
VPS29Q9UBQ0 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VPS29Q9UBQ0 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VPS29Q9UBQ0 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VPS29Q9UBQ0 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
VPS29Q9UBQ0 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
VPS29Q9UBQ0 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
VPS29Q9UBQ0 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VPS29Q9UBQ0 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VPS29Q9UBQ0 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
VPS29Q9UBQ0 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VPS29Q9UBQ0 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VPS29Q9UBQ0 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
VPS29Q9UBQ0 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VPS29Q9UBQ0 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VPS29Q9UBQ0 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
VPS29Q9UBQ0 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
VPS29Q9UBQ0 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VPS29Q9UBQ0 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
VPS29Q9UBQ0 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
VPS29Q9UBQ0 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VPS29Q9UBQ0 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
VPS29Q9UBQ0 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
VPS29Q9UBQ0 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
VPS29Q9UBQ0 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
VPS29Q9UBQ0 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
VPS29Q9UBQ0 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
VPS29Q9UBQ0 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VPS29Q9UBQ0 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VPS29Q9UBQ0 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
VPS29Q9UBQ0 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VPS29Q9UBQ0 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VPS29Q9UBQ0 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VPS29Q9UBQ0 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
VPS29Q9UBQ0 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
VPS29Q9UBQ0 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VPS29Q9UBQ0 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VPS29Q9UBQ0 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
VPS29Q9UBQ0 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VPS29Q9UBQ0 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VPS29Q9UBQ0 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
VPS29Q9UBQ0 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
VPS29Q9UBQ0 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VPS29Q9UBQ0 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VPS29Q9UBQ0 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
VPS29Q9UBQ0 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
VPS29Q9UBQ0 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VPS29Q9UBQ0 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VPS29Q9UBQ0 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
VPS29Q9UBQ0 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VPS29Q9UBQ0 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
VPS29Q9UBQ0 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VPS29Q9UBQ0 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VPS29Q9UBQ0 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
VPS29Q9UBQ0 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
VPS29Q9UBQ0 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
VPS29Q9UBQ0 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
VPS29Q9UBQ0 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
VPS29Q9UBQ0 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
VPS29Q9UBQ0 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VPS29Q9UBQ0 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VPS29Q9UBQ0 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VPS29Q9UBQ0 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VPS29Q9UBQ0 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VPS29Q9UBQ0 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VPS29Q9UBQ0 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
VPS29Q9UBQ0 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VPS29Q9UBQ0 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VPS29Q9UBQ0 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
VPS29Q9UBQ0 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
VPS29Q9UBQ0 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
VPS29Q9UBQ0 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
VPS29Q9UBQ0 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VPS29Q9UBQ0 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VPS29Q9UBQ0 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VPS29Q9UBQ0 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VPS29Q9UBQ0 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
VPS29Q9UBQ0 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VPS29Q9UBQ0 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VPS29Q9UBQ0 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
VPS29Q9UBQ0 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms