Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK2

PPARGC1A, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1AQ9UBK2 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms