Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL42Q9P2K6 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms