Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYP9

MIS18A, Protein Mis18-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIS18AQ9NYP9 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MIS18AQ9NYP9 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MIS18AQ9NYP9 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MIS18AQ9NYP9 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MIS18AQ9NYP9 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MIS18AQ9NYP9 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MIS18AQ9NYP9 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MIS18AQ9NYP9 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MIS18AQ9NYP9 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MIS18AQ9NYP9 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MIS18AQ9NYP9 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
MIS18AQ9NYP9 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MIS18AQ9NYP9 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MIS18AQ9NYP9 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MIS18AQ9NYP9 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MIS18AQ9NYP9 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MIS18AQ9NYP9 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MIS18AQ9NYP9 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MIS18AQ9NYP9 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MIS18AQ9NYP9 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MIS18AQ9NYP9 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MIS18AQ9NYP9 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MIS18AQ9NYP9 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MIS18AQ9NYP9 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MIS18AQ9NYP9 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MIS18AQ9NYP9 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MIS18AQ9NYP9 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MIS18AQ9NYP9 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MIS18AQ9NYP9 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MIS18AQ9NYP9 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MIS18AQ9NYP9 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MIS18AQ9NYP9 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MIS18AQ9NYP9 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MIS18AQ9NYP9 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MIS18AQ9NYP9 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
MIS18AQ9NYP9 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MIS18AQ9NYP9 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MIS18AQ9NYP9 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MIS18AQ9NYP9 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MIS18AQ9NYP9 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MIS18AQ9NYP9 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
MIS18AQ9NYP9 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MIS18AQ9NYP9 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MIS18AQ9NYP9 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MIS18AQ9NYP9 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MIS18AQ9NYP9 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MIS18AQ9NYP9 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MIS18AQ9NYP9 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MIS18AQ9NYP9 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MIS18AQ9NYP9 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MIS18AQ9NYP9 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MIS18AQ9NYP9 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MIS18AQ9NYP9 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
MIS18AQ9NYP9 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
MIS18AQ9NYP9 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
MIS18AQ9NYP9 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
MIS18AQ9NYP9 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MIS18AQ9NYP9 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
MIS18AQ9NYP9 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MIS18AQ9NYP9 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MIS18AQ9NYP9 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MIS18AQ9NYP9 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MIS18AQ9NYP9 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MIS18AQ9NYP9 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MIS18AQ9NYP9 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MIS18AQ9NYP9 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MIS18AQ9NYP9 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MIS18AQ9NYP9 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MIS18AQ9NYP9 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MIS18AQ9NYP9 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MIS18AQ9NYP9 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MIS18AQ9NYP9 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MIS18AQ9NYP9 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MIS18AQ9NYP9 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MIS18AQ9NYP9 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MIS18AQ9NYP9 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MIS18AQ9NYP9 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MIS18AQ9NYP9 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MIS18AQ9NYP9 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
MIS18AQ9NYP9 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MIS18AQ9NYP9 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MIS18AQ9NYP9 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MIS18AQ9NYP9 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MIS18AQ9NYP9 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
MIS18AQ9NYP9 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MIS18AQ9NYP9 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MIS18AQ9NYP9 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MIS18AQ9NYP9 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
MIS18AQ9NYP9 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MIS18AQ9NYP9 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MIS18AQ9NYP9 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MIS18AQ9NYP9 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MIS18AQ9NYP9 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MIS18AQ9NYP9 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MIS18AQ9NYP9 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MIS18AQ9NYP9 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MIS18AQ9NYP9 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MIS18AQ9NYP9 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MIS18AQ9NYP9 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MIS18AQ9NYP9 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms