Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYI0

PSD3, PH and SEC7 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSD3Q9NYI0 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSD3Q9NYI0 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms