Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXC10Q9NYD6 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXC10Q9NYD6 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXC10Q9NYD6 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXC10Q9NYD6 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXC10Q9NYD6 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXC10Q9NYD6 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXC10Q9NYD6 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXC10Q9NYD6 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXC10Q9NYD6 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXC10Q9NYD6 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXC10Q9NYD6 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXC10Q9NYD6 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXC10Q9NYD6 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXC10Q9NYD6 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXC10Q9NYD6 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXC10Q9NYD6 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXC10Q9NYD6 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXC10Q9NYD6 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXC10Q9NYD6 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXC10Q9NYD6 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXC10Q9NYD6 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXC10Q9NYD6 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXC10Q9NYD6 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXC10Q9NYD6 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXC10Q9NYD6 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXC10Q9NYD6 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXC10Q9NYD6 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXC10Q9NYD6 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXC10Q9NYD6 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXC10Q9NYD6 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXC10Q9NYD6 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXC10Q9NYD6 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXC10Q9NYD6 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXC10Q9NYD6 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXC10Q9NYD6 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXC10Q9NYD6 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXC10Q9NYD6 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXC10Q9NYD6 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXC10Q9NYD6 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXC10Q9NYD6 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXC10Q9NYD6 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXC10Q9NYD6 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXC10Q9NYD6 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXC10Q9NYD6 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXC10Q9NYD6 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXC10Q9NYD6 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXC10Q9NYD6 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXC10Q9NYD6 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXC10Q9NYD6 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXC10Q9NYD6 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXC10Q9NYD6 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXC10Q9NYD6 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXC10Q9NYD6 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXC10Q9NYD6 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXC10Q9NYD6 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXC10Q9NYD6 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXC10Q9NYD6 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXC10Q9NYD6 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXC10Q9NYD6 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXC10Q9NYD6 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXC10Q9NYD6 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXC10Q9NYD6 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXC10Q9NYD6 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXC10Q9NYD6 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXC10Q9NYD6 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXC10Q9NYD6 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXC10Q9NYD6 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXC10Q9NYD6 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXC10Q9NYD6 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXC10Q9NYD6 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXC10Q9NYD6 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXC10Q9NYD6 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXC10Q9NYD6 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXC10Q9NYD6 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXC10Q9NYD6 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXC10Q9NYD6 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXC10Q9NYD6 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXC10Q9NYD6 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXC10Q9NYD6 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXC10Q9NYD6 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXC10Q9NYD6 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXC10Q9NYD6 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXC10Q9NYD6 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXC10Q9NYD6 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXC10Q9NYD6 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXC10Q9NYD6 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXC10Q9NYD6 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXC10Q9NYD6 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXC10Q9NYD6 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXC10Q9NYD6 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXC10Q9NYD6 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXC10Q9NYD6 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXC10Q9NYD6 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXC10Q9NYD6 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXC10Q9NYD6 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXC10Q9NYD6 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXC10Q9NYD6 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXC10Q9NYD6 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXC10Q9NYD6 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms