Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVP2

ASF1B, Histone chaperone ASF1B, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASF1BQ9NVP2 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ASF1BQ9NVP2 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms