Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRP4

SDHAF3, Succinate dehydrogenase assembly factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHAF3Q9NRP4 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SDHAF3Q9NRP4 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SDHAF3Q9NRP4 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SDHAF3Q9NRP4 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SDHAF3Q9NRP4 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SDHAF3Q9NRP4 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SDHAF3Q9NRP4 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SDHAF3Q9NRP4 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SDHAF3Q9NRP4 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SDHAF3Q9NRP4 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SDHAF3Q9NRP4 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SDHAF3Q9NRP4 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SDHAF3Q9NRP4 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SDHAF3Q9NRP4 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SDHAF3Q9NRP4 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SDHAF3Q9NRP4 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SDHAF3Q9NRP4 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SDHAF3Q9NRP4 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SDHAF3Q9NRP4 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SDHAF3Q9NRP4 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SDHAF3Q9NRP4 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SDHAF3Q9NRP4 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SDHAF3Q9NRP4 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SDHAF3Q9NRP4 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SDHAF3Q9NRP4 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SDHAF3Q9NRP4 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SDHAF3Q9NRP4 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SDHAF3Q9NRP4 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SDHAF3Q9NRP4 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SDHAF3Q9NRP4 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SDHAF3Q9NRP4 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SDHAF3Q9NRP4 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SDHAF3Q9NRP4 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SDHAF3Q9NRP4 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SDHAF3Q9NRP4 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SDHAF3Q9NRP4 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SDHAF3Q9NRP4 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SDHAF3Q9NRP4 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SDHAF3Q9NRP4 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SDHAF3Q9NRP4 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SDHAF3Q9NRP4 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SDHAF3Q9NRP4 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SDHAF3Q9NRP4 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SDHAF3Q9NRP4 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SDHAF3Q9NRP4 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SDHAF3Q9NRP4 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SDHAF3Q9NRP4 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SDHAF3Q9NRP4 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SDHAF3Q9NRP4 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SDHAF3Q9NRP4 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SDHAF3Q9NRP4 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SDHAF3Q9NRP4 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SDHAF3Q9NRP4 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SDHAF3Q9NRP4 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SDHAF3Q9NRP4 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SDHAF3Q9NRP4 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SDHAF3Q9NRP4 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SDHAF3Q9NRP4 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SDHAF3Q9NRP4 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SDHAF3Q9NRP4 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SDHAF3Q9NRP4 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SDHAF3Q9NRP4 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SDHAF3Q9NRP4 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SDHAF3Q9NRP4 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SDHAF3Q9NRP4 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SDHAF3Q9NRP4 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SDHAF3Q9NRP4 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SDHAF3Q9NRP4 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SDHAF3Q9NRP4 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SDHAF3Q9NRP4 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SDHAF3Q9NRP4 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SDHAF3Q9NRP4 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SDHAF3Q9NRP4 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SDHAF3Q9NRP4 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SDHAF3Q9NRP4 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SDHAF3Q9NRP4 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SDHAF3Q9NRP4 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SDHAF3Q9NRP4 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SDHAF3Q9NRP4 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SDHAF3Q9NRP4 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SDHAF3Q9NRP4 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SDHAF3Q9NRP4 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SDHAF3Q9NRP4 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SDHAF3Q9NRP4 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SDHAF3Q9NRP4 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SDHAF3Q9NRP4 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SDHAF3Q9NRP4 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SDHAF3Q9NRP4 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SDHAF3Q9NRP4 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SDHAF3Q9NRP4 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SDHAF3Q9NRP4 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SDHAF3Q9NRP4 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SDHAF3Q9NRP4 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SDHAF3Q9NRP4 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SDHAF3Q9NRP4 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SDHAF3Q9NRP4 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SDHAF3Q9NRP4 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SDHAF3Q9NRP4 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SDHAF3Q9NRP4 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SDHAF3Q9NRP4 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms