Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQW8

CNGB3, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-3, humanhuman

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Length 809 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB3Q9NQW8 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
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CNGB3Q9NQW8 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNGB3Q9NQW8 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNGB3Q9NQW8 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
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