Protein–RNA interactions for Protein: Q9NNZ6

PRM3, Protamine-3, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRM3Q9NNZ6 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PRM3Q9NNZ6 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PRM3Q9NNZ6 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRM3Q9NNZ6 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRM3Q9NNZ6 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRM3Q9NNZ6 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRM3Q9NNZ6 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRM3Q9NNZ6 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRM3Q9NNZ6 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRM3Q9NNZ6 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRM3Q9NNZ6 MGRN1-203ENST00000415496 6405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRM3Q9NNZ6 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRM3Q9NNZ6 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRM3Q9NNZ6 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PRM3Q9NNZ6 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRM3Q9NNZ6 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRM3Q9NNZ6 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRM3Q9NNZ6 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRM3Q9NNZ6 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRM3Q9NNZ6 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRM3Q9NNZ6 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRM3Q9NNZ6 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRM3Q9NNZ6 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRM3Q9NNZ6 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRM3Q9NNZ6 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRM3Q9NNZ6 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRM3Q9NNZ6 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRM3Q9NNZ6 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRM3Q9NNZ6 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRM3Q9NNZ6 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRM3Q9NNZ6 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRM3Q9NNZ6 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRM3Q9NNZ6 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRM3Q9NNZ6 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRM3Q9NNZ6 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRM3Q9NNZ6 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRM3Q9NNZ6 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRM3Q9NNZ6 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PRM3Q9NNZ6 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRM3Q9NNZ6 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRM3Q9NNZ6 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRM3Q9NNZ6 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRM3Q9NNZ6 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRM3Q9NNZ6 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRM3Q9NNZ6 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRM3Q9NNZ6 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRM3Q9NNZ6 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRM3Q9NNZ6 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRM3Q9NNZ6 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRM3Q9NNZ6 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRM3Q9NNZ6 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRM3Q9NNZ6 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRM3Q9NNZ6 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRM3Q9NNZ6 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PRM3Q9NNZ6 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRM3Q9NNZ6 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRM3Q9NNZ6 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRM3Q9NNZ6 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRM3Q9NNZ6 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRM3Q9NNZ6 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRM3Q9NNZ6 PTPRS-204ENST00000587303 6353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRM3Q9NNZ6 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRM3Q9NNZ6 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRM3Q9NNZ6 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRM3Q9NNZ6 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRM3Q9NNZ6 ICE1-201ENST00000296564 7927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRM3Q9NNZ6 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRM3Q9NNZ6 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRM3Q9NNZ6 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRM3Q9NNZ6 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRM3Q9NNZ6 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PRM3Q9NNZ6 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRM3Q9NNZ6 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRM3Q9NNZ6 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PRM3Q9NNZ6 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PRM3Q9NNZ6 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PRM3Q9NNZ6 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PRM3Q9NNZ6 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PRM3Q9NNZ6 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PRM3Q9NNZ6 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PRM3Q9NNZ6 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PRM3Q9NNZ6 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PRM3Q9NNZ6 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PRM3Q9NNZ6 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PRM3Q9NNZ6 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PRM3Q9NNZ6 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PRM3Q9NNZ6 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PRM3Q9NNZ6 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PRM3Q9NNZ6 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PRM3Q9NNZ6 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PRM3Q9NNZ6 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRM3Q9NNZ6 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRM3Q9NNZ6 CRYBG1-201ENST00000369066 7553 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRM3Q9NNZ6 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRM3Q9NNZ6 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRM3Q9NNZ6 AFF3-201ENST00000317233 8135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRM3Q9NNZ6 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRM3Q9NNZ6 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRM3Q9NNZ6 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRM3Q9NNZ6 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms