Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB65

ELL3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3Q9HB65 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms