Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW4

CLSPN, Claspin, humanhuman

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPNQ9HAW4 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLSPNQ9HAW4 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLSPNQ9HAW4 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLSPNQ9HAW4 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLSPNQ9HAW4 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLSPNQ9HAW4 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLSPNQ9HAW4 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLSPNQ9HAW4 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLSPNQ9HAW4 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLSPNQ9HAW4 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLSPNQ9HAW4 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLSPNQ9HAW4 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLSPNQ9HAW4 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLSPNQ9HAW4 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLSPNQ9HAW4 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLSPNQ9HAW4 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLSPNQ9HAW4 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLSPNQ9HAW4 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLSPNQ9HAW4 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLSPNQ9HAW4 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLSPNQ9HAW4 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLSPNQ9HAW4 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLSPNQ9HAW4 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CLSPNQ9HAW4 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLSPNQ9HAW4 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLSPNQ9HAW4 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLSPNQ9HAW4 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CLSPNQ9HAW4 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLSPNQ9HAW4 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLSPNQ9HAW4 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CLSPNQ9HAW4 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CLSPNQ9HAW4 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLSPNQ9HAW4 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLSPNQ9HAW4 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLSPNQ9HAW4 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLSPNQ9HAW4 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLSPNQ9HAW4 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLSPNQ9HAW4 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLSPNQ9HAW4 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLSPNQ9HAW4 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLSPNQ9HAW4 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLSPNQ9HAW4 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLSPNQ9HAW4 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLSPNQ9HAW4 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLSPNQ9HAW4 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLSPNQ9HAW4 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLSPNQ9HAW4 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CLSPNQ9HAW4 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLSPNQ9HAW4 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLSPNQ9HAW4 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLSPNQ9HAW4 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLSPNQ9HAW4 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CLSPNQ9HAW4 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLSPNQ9HAW4 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLSPNQ9HAW4 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLSPNQ9HAW4 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLSPNQ9HAW4 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLSPNQ9HAW4 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CLSPNQ9HAW4 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLSPNQ9HAW4 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLSPNQ9HAW4 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLSPNQ9HAW4 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLSPNQ9HAW4 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLSPNQ9HAW4 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLSPNQ9HAW4 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLSPNQ9HAW4 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLSPNQ9HAW4 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLSPNQ9HAW4 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CLSPNQ9HAW4 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLSPNQ9HAW4 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLSPNQ9HAW4 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLSPNQ9HAW4 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLSPNQ9HAW4 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLSPNQ9HAW4 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLSPNQ9HAW4 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLSPNQ9HAW4 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLSPNQ9HAW4 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLSPNQ9HAW4 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLSPNQ9HAW4 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLSPNQ9HAW4 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLSPNQ9HAW4 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLSPNQ9HAW4 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CLSPNQ9HAW4 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLSPNQ9HAW4 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLSPNQ9HAW4 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLSPNQ9HAW4 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLSPNQ9HAW4 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLSPNQ9HAW4 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLSPNQ9HAW4 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLSPNQ9HAW4 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLSPNQ9HAW4 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLSPNQ9HAW4 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLSPNQ9HAW4 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLSPNQ9HAW4 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLSPNQ9HAW4 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLSPNQ9HAW4 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLSPNQ9HAW4 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLSPNQ9HAW4 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLSPNQ9HAW4 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLSPNQ9HAW4 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms