Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAB3

SLC52A2, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC52A2Q9HAB3 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC52A2Q9HAB3 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC52A2Q9HAB3 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC52A2Q9HAB3 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC52A2Q9HAB3 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC52A2Q9HAB3 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC52A2Q9HAB3 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC52A2Q9HAB3 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC52A2Q9HAB3 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC52A2Q9HAB3 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC52A2Q9HAB3 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC52A2Q9HAB3 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC52A2Q9HAB3 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC52A2Q9HAB3 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC52A2Q9HAB3 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC52A2Q9HAB3 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC52A2Q9HAB3 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC52A2Q9HAB3 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC52A2Q9HAB3 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC52A2Q9HAB3 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC52A2Q9HAB3 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC52A2Q9HAB3 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC52A2Q9HAB3 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC52A2Q9HAB3 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC52A2Q9HAB3 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC52A2Q9HAB3 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC52A2Q9HAB3 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC52A2Q9HAB3 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC52A2Q9HAB3 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC52A2Q9HAB3 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC52A2Q9HAB3 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC52A2Q9HAB3 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC52A2Q9HAB3 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC52A2Q9HAB3 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC52A2Q9HAB3 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC52A2Q9HAB3 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC52A2Q9HAB3 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC52A2Q9HAB3 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC52A2Q9HAB3 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC52A2Q9HAB3 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC52A2Q9HAB3 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC52A2Q9HAB3 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC52A2Q9HAB3 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC52A2Q9HAB3 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC52A2Q9HAB3 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC52A2Q9HAB3 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC52A2Q9HAB3 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC52A2Q9HAB3 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC52A2Q9HAB3 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC52A2Q9HAB3 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC52A2Q9HAB3 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC52A2Q9HAB3 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC52A2Q9HAB3 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC52A2Q9HAB3 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC52A2Q9HAB3 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC52A2Q9HAB3 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC52A2Q9HAB3 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC52A2Q9HAB3 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC52A2Q9HAB3 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC52A2Q9HAB3 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC52A2Q9HAB3 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC52A2Q9HAB3 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC52A2Q9HAB3 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC52A2Q9HAB3 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC52A2Q9HAB3 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC52A2Q9HAB3 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC52A2Q9HAB3 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC52A2Q9HAB3 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC52A2Q9HAB3 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC52A2Q9HAB3 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC52A2Q9HAB3 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC52A2Q9HAB3 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC52A2Q9HAB3 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC52A2Q9HAB3 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC52A2Q9HAB3 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC52A2Q9HAB3 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC52A2Q9HAB3 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC52A2Q9HAB3 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC52A2Q9HAB3 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC52A2Q9HAB3 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC52A2Q9HAB3 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC52A2Q9HAB3 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC52A2Q9HAB3 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC52A2Q9HAB3 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC52A2Q9HAB3 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC52A2Q9HAB3 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC52A2Q9HAB3 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC52A2Q9HAB3 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC52A2Q9HAB3 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC52A2Q9HAB3 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC52A2Q9HAB3 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC52A2Q9HAB3 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC52A2Q9HAB3 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC52A2Q9HAB3 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC52A2Q9HAB3 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC52A2Q9HAB3 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC52A2Q9HAB3 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC52A2Q9HAB3 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC52A2Q9HAB3 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC52A2Q9HAB3 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms