Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM3

POLR2J2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J2Q9GZM3 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLR2J2Q9GZM3 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms