Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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SMIM3Q9BZL3 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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SMIM3Q9BZL3 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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SMIM3Q9BZL3 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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SMIM3Q9BZL3 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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SMIM3Q9BZL3 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMIM3Q9BZL3 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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