Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV2

TRIM54, Tripartite motif-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54Q9BYV2 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM54Q9BYV2 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM54Q9BYV2 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM54Q9BYV2 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM54Q9BYV2 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM54Q9BYV2 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM54Q9BYV2 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM54Q9BYV2 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM54Q9BYV2 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM54Q9BYV2 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM54Q9BYV2 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM54Q9BYV2 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM54Q9BYV2 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM54Q9BYV2 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM54Q9BYV2 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM54Q9BYV2 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM54Q9BYV2 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM54Q9BYV2 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM54Q9BYV2 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM54Q9BYV2 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM54Q9BYV2 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM54Q9BYV2 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM54Q9BYV2 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM54Q9BYV2 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM54Q9BYV2 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM54Q9BYV2 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM54Q9BYV2 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM54Q9BYV2 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM54Q9BYV2 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM54Q9BYV2 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM54Q9BYV2 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM54Q9BYV2 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM54Q9BYV2 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM54Q9BYV2 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM54Q9BYV2 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM54Q9BYV2 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM54Q9BYV2 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM54Q9BYV2 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM54Q9BYV2 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM54Q9BYV2 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM54Q9BYV2 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM54Q9BYV2 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM54Q9BYV2 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM54Q9BYV2 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM54Q9BYV2 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM54Q9BYV2 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM54Q9BYV2 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM54Q9BYV2 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM54Q9BYV2 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM54Q9BYV2 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM54Q9BYV2 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM54Q9BYV2 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM54Q9BYV2 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM54Q9BYV2 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM54Q9BYV2 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM54Q9BYV2 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM54Q9BYV2 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM54Q9BYV2 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM54Q9BYV2 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM54Q9BYV2 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM54Q9BYV2 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM54Q9BYV2 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM54Q9BYV2 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM54Q9BYV2 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM54Q9BYV2 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM54Q9BYV2 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM54Q9BYV2 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM54Q9BYV2 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM54Q9BYV2 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM54Q9BYV2 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM54Q9BYV2 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM54Q9BYV2 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms