Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXY4

RSPO3, R-spondin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPO3Q9BXY4 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RSPO3Q9BXY4 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RSPO3Q9BXY4 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RSPO3Q9BXY4 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RSPO3Q9BXY4 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RSPO3Q9BXY4 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RSPO3Q9BXY4 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RSPO3Q9BXY4 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RSPO3Q9BXY4 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RSPO3Q9BXY4 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RSPO3Q9BXY4 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RSPO3Q9BXY4 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RSPO3Q9BXY4 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RSPO3Q9BXY4 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RSPO3Q9BXY4 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RSPO3Q9BXY4 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RSPO3Q9BXY4 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RSPO3Q9BXY4 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RSPO3Q9BXY4 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RSPO3Q9BXY4 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RSPO3Q9BXY4 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RSPO3Q9BXY4 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RSPO3Q9BXY4 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RSPO3Q9BXY4 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RSPO3Q9BXY4 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RSPO3Q9BXY4 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RSPO3Q9BXY4 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RSPO3Q9BXY4 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RSPO3Q9BXY4 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RSPO3Q9BXY4 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RSPO3Q9BXY4 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RSPO3Q9BXY4 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RSPO3Q9BXY4 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RSPO3Q9BXY4 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RSPO3Q9BXY4 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RSPO3Q9BXY4 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RSPO3Q9BXY4 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RSPO3Q9BXY4 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RSPO3Q9BXY4 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RSPO3Q9BXY4 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RSPO3Q9BXY4 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RSPO3Q9BXY4 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RSPO3Q9BXY4 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RSPO3Q9BXY4 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RSPO3Q9BXY4 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RSPO3Q9BXY4 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RSPO3Q9BXY4 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RSPO3Q9BXY4 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RSPO3Q9BXY4 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RSPO3Q9BXY4 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RSPO3Q9BXY4 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RSPO3Q9BXY4 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RSPO3Q9BXY4 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RSPO3Q9BXY4 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RSPO3Q9BXY4 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RSPO3Q9BXY4 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RSPO3Q9BXY4 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RSPO3Q9BXY4 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RSPO3Q9BXY4 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RSPO3Q9BXY4 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RSPO3Q9BXY4 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RSPO3Q9BXY4 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RSPO3Q9BXY4 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RSPO3Q9BXY4 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RSPO3Q9BXY4 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RSPO3Q9BXY4 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RSPO3Q9BXY4 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RSPO3Q9BXY4 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RSPO3Q9BXY4 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RSPO3Q9BXY4 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RSPO3Q9BXY4 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RSPO3Q9BXY4 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RSPO3Q9BXY4 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RSPO3Q9BXY4 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RSPO3Q9BXY4 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RSPO3Q9BXY4 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RSPO3Q9BXY4 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RSPO3Q9BXY4 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RSPO3Q9BXY4 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RSPO3Q9BXY4 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RSPO3Q9BXY4 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RSPO3Q9BXY4 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RSPO3Q9BXY4 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RSPO3Q9BXY4 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RSPO3Q9BXY4 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RSPO3Q9BXY4 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RSPO3Q9BXY4 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RSPO3Q9BXY4 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RSPO3Q9BXY4 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RSPO3Q9BXY4 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RSPO3Q9BXY4 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RSPO3Q9BXY4 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RSPO3Q9BXY4 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RSPO3Q9BXY4 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RSPO3Q9BXY4 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RSPO3Q9BXY4 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RSPO3Q9BXY4 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RSPO3Q9BXY4 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RSPO3Q9BXY4 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RSPO3Q9BXY4 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms