Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTC8

MTA3, Metastasis-associated protein MTA3, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTA3Q9BTC8 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MTA3Q9BTC8 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MTA3Q9BTC8 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MTA3Q9BTC8 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MTA3Q9BTC8 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MTA3Q9BTC8 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
MTA3Q9BTC8 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
MTA3Q9BTC8 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MTA3Q9BTC8 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MTA3Q9BTC8 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MTA3Q9BTC8 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MTA3Q9BTC8 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MTA3Q9BTC8 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MTA3Q9BTC8 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MTA3Q9BTC8 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MTA3Q9BTC8 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MTA3Q9BTC8 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MTA3Q9BTC8 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MTA3Q9BTC8 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MTA3Q9BTC8 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MTA3Q9BTC8 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MTA3Q9BTC8 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MTA3Q9BTC8 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MTA3Q9BTC8 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MTA3Q9BTC8 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MTA3Q9BTC8 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MTA3Q9BTC8 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MTA3Q9BTC8 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MTA3Q9BTC8 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
MTA3Q9BTC8 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MTA3Q9BTC8 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MTA3Q9BTC8 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MTA3Q9BTC8 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MTA3Q9BTC8 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MTA3Q9BTC8 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MTA3Q9BTC8 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MTA3Q9BTC8 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MTA3Q9BTC8 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
MTA3Q9BTC8 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MTA3Q9BTC8 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MTA3Q9BTC8 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MTA3Q9BTC8 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MTA3Q9BTC8 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MTA3Q9BTC8 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MTA3Q9BTC8 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MTA3Q9BTC8 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MTA3Q9BTC8 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MTA3Q9BTC8 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
MTA3Q9BTC8 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MTA3Q9BTC8 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MTA3Q9BTC8 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MTA3Q9BTC8 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MTA3Q9BTC8 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MTA3Q9BTC8 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MTA3Q9BTC8 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MTA3Q9BTC8 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MTA3Q9BTC8 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MTA3Q9BTC8 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MTA3Q9BTC8 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MTA3Q9BTC8 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
MTA3Q9BTC8 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MTA3Q9BTC8 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MTA3Q9BTC8 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MTA3Q9BTC8 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MTA3Q9BTC8 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
MTA3Q9BTC8 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MTA3Q9BTC8 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MTA3Q9BTC8 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MTA3Q9BTC8 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MTA3Q9BTC8 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MTA3Q9BTC8 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MTA3Q9BTC8 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MTA3Q9BTC8 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MTA3Q9BTC8 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MTA3Q9BTC8 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MTA3Q9BTC8 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MTA3Q9BTC8 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MTA3Q9BTC8 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MTA3Q9BTC8 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MTA3Q9BTC8 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MTA3Q9BTC8 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MTA3Q9BTC8 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MTA3Q9BTC8 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
MTA3Q9BTC8 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MTA3Q9BTC8 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
MTA3Q9BTC8 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MTA3Q9BTC8 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MTA3Q9BTC8 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MTA3Q9BTC8 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MTA3Q9BTC8 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MTA3Q9BTC8 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MTA3Q9BTC8 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MTA3Q9BTC8 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MTA3Q9BTC8 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
MTA3Q9BTC8 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MTA3Q9BTC8 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MTA3Q9BTC8 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MTA3Q9BTC8 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MTA3Q9BTC8 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MTA3Q9BTC8 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms