Protein–RNA interactions for Protein: Q99856

ARID3A, AT-rich interactive domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3AQ99856 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARID3AQ99856 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARID3AQ99856 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARID3AQ99856 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARID3AQ99856 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARID3AQ99856 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARID3AQ99856 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARID3AQ99856 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARID3AQ99856 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARID3AQ99856 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARID3AQ99856 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARID3AQ99856 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARID3AQ99856 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARID3AQ99856 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ARID3AQ99856 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARID3AQ99856 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARID3AQ99856 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARID3AQ99856 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ARID3AQ99856 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARID3AQ99856 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARID3AQ99856 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARID3AQ99856 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARID3AQ99856 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARID3AQ99856 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARID3AQ99856 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARID3AQ99856 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARID3AQ99856 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARID3AQ99856 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ARID3AQ99856 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARID3AQ99856 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARID3AQ99856 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARID3AQ99856 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARID3AQ99856 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARID3AQ99856 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARID3AQ99856 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARID3AQ99856 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARID3AQ99856 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARID3AQ99856 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARID3AQ99856 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARID3AQ99856 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARID3AQ99856 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARID3AQ99856 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARID3AQ99856 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARID3AQ99856 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARID3AQ99856 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARID3AQ99856 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARID3AQ99856 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARID3AQ99856 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ARID3AQ99856 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARID3AQ99856 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARID3AQ99856 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ARID3AQ99856 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ARID3AQ99856 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARID3AQ99856 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARID3AQ99856 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARID3AQ99856 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARID3AQ99856 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARID3AQ99856 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARID3AQ99856 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARID3AQ99856 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARID3AQ99856 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ARID3AQ99856 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARID3AQ99856 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARID3AQ99856 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARID3AQ99856 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARID3AQ99856 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARID3AQ99856 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARID3AQ99856 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARID3AQ99856 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARID3AQ99856 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARID3AQ99856 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARID3AQ99856 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARID3AQ99856 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARID3AQ99856 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARID3AQ99856 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARID3AQ99856 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARID3AQ99856 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARID3AQ99856 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARID3AQ99856 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARID3AQ99856 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARID3AQ99856 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARID3AQ99856 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARID3AQ99856 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARID3AQ99856 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ARID3AQ99856 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARID3AQ99856 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARID3AQ99856 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ARID3AQ99856 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARID3AQ99856 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARID3AQ99856 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARID3AQ99856 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARID3AQ99856 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARID3AQ99856 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARID3AQ99856 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARID3AQ99856 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARID3AQ99856 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARID3AQ99856 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARID3AQ99856 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARID3AQ99856 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARID3AQ99856 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms