Protein–RNA interactions for Protein: Q96T59

CDRT15, CMT1A duplicated region transcript 15 protein, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDRT15Q96T59 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDRT15Q96T59 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDRT15Q96T59 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDRT15Q96T59 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CDRT15Q96T59 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDRT15Q96T59 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDRT15Q96T59 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDRT15Q96T59 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDRT15Q96T59 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDRT15Q96T59 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDRT15Q96T59 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDRT15Q96T59 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDRT15Q96T59 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDRT15Q96T59 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDRT15Q96T59 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDRT15Q96T59 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDRT15Q96T59 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDRT15Q96T59 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDRT15Q96T59 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDRT15Q96T59 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDRT15Q96T59 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDRT15Q96T59 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDRT15Q96T59 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDRT15Q96T59 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CDRT15Q96T59 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDRT15Q96T59 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDRT15Q96T59 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDRT15Q96T59 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDRT15Q96T59 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDRT15Q96T59 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDRT15Q96T59 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDRT15Q96T59 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDRT15Q96T59 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDRT15Q96T59 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDRT15Q96T59 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDRT15Q96T59 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDRT15Q96T59 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDRT15Q96T59 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDRT15Q96T59 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDRT15Q96T59 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDRT15Q96T59 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDRT15Q96T59 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDRT15Q96T59 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDRT15Q96T59 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDRT15Q96T59 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDRT15Q96T59 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDRT15Q96T59 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDRT15Q96T59 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDRT15Q96T59 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDRT15Q96T59 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDRT15Q96T59 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDRT15Q96T59 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDRT15Q96T59 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDRT15Q96T59 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDRT15Q96T59 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDRT15Q96T59 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDRT15Q96T59 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDRT15Q96T59 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDRT15Q96T59 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDRT15Q96T59 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDRT15Q96T59 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDRT15Q96T59 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDRT15Q96T59 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDRT15Q96T59 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDRT15Q96T59 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDRT15Q96T59 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDRT15Q96T59 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDRT15Q96T59 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDRT15Q96T59 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDRT15Q96T59 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDRT15Q96T59 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDRT15Q96T59 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDRT15Q96T59 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDRT15Q96T59 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDRT15Q96T59 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDRT15Q96T59 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDRT15Q96T59 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDRT15Q96T59 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDRT15Q96T59 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDRT15Q96T59 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDRT15Q96T59 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDRT15Q96T59 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDRT15Q96T59 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDRT15Q96T59 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDRT15Q96T59 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDRT15Q96T59 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDRT15Q96T59 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDRT15Q96T59 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CDRT15Q96T59 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDRT15Q96T59 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDRT15Q96T59 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDRT15Q96T59 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDRT15Q96T59 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDRT15Q96T59 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDRT15Q96T59 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDRT15Q96T59 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CDRT15Q96T59 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDRT15Q96T59 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDRT15Q96T59 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDRT15Q96T59 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms