Protein–RNA interactions for Protein: Q96RJ3

TNFRSF13C, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF13CQ96RJ3 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFRSF13CQ96RJ3 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFRSF13CQ96RJ3 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFRSF13CQ96RJ3 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFRSF13CQ96RJ3 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFRSF13CQ96RJ3 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFRSF13CQ96RJ3 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFRSF13CQ96RJ3 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFRSF13CQ96RJ3 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFRSF13CQ96RJ3 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TNFRSF13CQ96RJ3 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TNFRSF13CQ96RJ3 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TNFRSF13CQ96RJ3 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TNFRSF13CQ96RJ3 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TNFRSF13CQ96RJ3 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TNFRSF13CQ96RJ3 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFRSF13CQ96RJ3 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms