Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB3

HIC2, Hypermethylated in cancer 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 615 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIC2Q96JB3 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
HIC2Q96JB3 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HIC2Q96JB3 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HIC2Q96JB3 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HIC2Q96JB3 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HIC2Q96JB3 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HIC2Q96JB3 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
HIC2Q96JB3 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
HIC2Q96JB3 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HIC2Q96JB3 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HIC2Q96JB3 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HIC2Q96JB3 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HIC2Q96JB3 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HIC2Q96JB3 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HIC2Q96JB3 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HIC2Q96JB3 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HIC2Q96JB3 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HIC2Q96JB3 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HIC2Q96JB3 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
HIC2Q96JB3 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HIC2Q96JB3 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HIC2Q96JB3 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HIC2Q96JB3 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HIC2Q96JB3 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HIC2Q96JB3 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HIC2Q96JB3 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HIC2Q96JB3 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HIC2Q96JB3 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HIC2Q96JB3 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HIC2Q96JB3 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HIC2Q96JB3 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HIC2Q96JB3 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
HIC2Q96JB3 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
HIC2Q96JB3 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HIC2Q96JB3 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HIC2Q96JB3 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HIC2Q96JB3 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HIC2Q96JB3 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
HIC2Q96JB3 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HIC2Q96JB3 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HIC2Q96JB3 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HIC2Q96JB3 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HIC2Q96JB3 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HIC2Q96JB3 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HIC2Q96JB3 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HIC2Q96JB3 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HIC2Q96JB3 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms